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凝膠成像系統:如何為您選擇一個

快速:您實驗室中**常用的設備是什麼?移液器可能占據首位,但凝膠文件系統可能位居前三位。

凝膠文件系統實際上隻不過是一個微型暗室和相關的相機。在80年代後期和90年代早期,這些系統實際上是便攜式暗室,包括安裝在金字塔底座上的基本寶麗來打印相機。将組件放在燈箱上的凝膠上,然後拍攝照片。一旦開發打印所需的幾秒鐘過去,生成的灰度照片就會粘貼到實驗室筆記本中。

但DNA和蛋白質凝膠不僅僅是令人欽佩的圖像,就像家庭相冊中的照片一樣; 他們是數據。必須對它們進行研究,分析,注釋和(希望)發表。它們還必須存儲并可供以後檢索。不幸的是,這些任務對于打印圖像來說都不是很簡單,打印圖像可能會損壞或丢失,并且必須掃描到計算機中以進行後續圖像分析。

幸運的是,今天的實驗室工作人員有更複雜的選擇。現代凝膠文件系統的範圍從半自動到全自動,具有多功能外殼,計算機控制的激發和檢測系統以及分析軟件。這些裝置不僅可以處理DNA和蛋白質凝膠,還可以處理化學發光蛋白質印迹,熒光,甚**放射自顯影。出于本文的目的,我們将讨論限制在**基本的系統 - 那些可以處理DNA和蛋白質凝膠的系統。

應用

購買凝膠文件系統時,首先詢問,我的需求是什麼?您是否将該系統專門用于DNA和蛋白質凝膠,或者您是否還需要記錄熒光實驗,化學發光蛋白質印迹和放射自顯影?在前一種情況下,幾乎所有系統都會這樣做,您的選擇将取決于您想要花多少錢以及您決定需要哪些功能; 在後一種情況下,您需要考慮更高端的選擇。

“通常,切斷點是,他們是在做化學發光西部片嗎?” Cell Biosciences的産品經理Peter Chiang說。化學發光需要冷卻的CCD相機,這比通常與凝膠文件系統捆綁的相機貴得多。

價錢

蔣說,一旦潛在客戶确定了他們的應用程序,他們首先要知道的是,系統将花費我多少錢?“這通常是讨論開始的地方,價格範圍是多少,”蔣說。

當然,這是俄亥俄州立大學獸醫學院研究科學家Kate Hayes-Ozello的“**大因素”,他參與購買學院的兩個AlphaImager系統(**初由AlphaInnotech出售,現在由細胞生物科學)。“價格是我看到的**件事,”她說。

一般來說,基本的凝膠文件系統的價格可能低于10,000美元,可能低于5,000美元,具體取決于相機質量,自動化水平和系統捆綁軟件質量等特性。例如,Cell Biosciences的凝膠文件系統從基本的AlphaImager Mini的3,800美元到**的AlphaImager HP的12,000美元。

燈光

DNA和蛋白質凝膠具有相對簡單的照明要求。對于用溴化乙錠或SYBR綠染色的DNA凝膠,您需要一個紫外透射儀。對于考馬斯染色的蛋白質凝膠,伱需要白光透照。您可能還希望進行白光落射照明(即,從上方照射)用于成像,例如細菌闆,和/或藍光“轉換器屏幕”,其可以将UV光轉換為藍光以切除SYBR綠 - 染色DNA條帶而不損壞它們。(如果您确實需要從凝膠中切除條帶,請尋找可以将透照儀從系統機櫃中取出以便于接觸凝膠的系統。)

攝像機/光學

當然,凝膠文件系統操作的關鍵是用于捕獲圖像的相機和鏡頭。

“伱可能首先要看的是相機,”蔣說,“這通常是**昂貴,**具差異化的部分。”

首先,蔣說,解決; 大多數gel-doc系統都有“科學級”相機,分辨率在0.3到2百萬像素(MP)之間,他說 - 低于1 MP的任何東西都被認為是“低端的”。

接下來,考慮一下鏡頭。它們是固定的,還是可以放大?什麼是**大放大倍率,是變焦光學(即鏡頭實際移動)還是電子(如手機相機)?鏡頭是電腦控制的還是手動的?**後,根據您的需要,您可能還需要考慮可以在相機前放置多少個不同的濾鏡。

例如,AlphaImager Mini包括一個1.3-MP,12位攝像頭(一個12位攝像頭可以捕獲2 12或4,096個灰色陰影),一個位置的濾光輪(标準配置包括一個橙色濾鏡)對于溴化乙錠,雖然有其他可用)和手動變焦鏡頭(8-48毫米,f / 1.2)。所述Syngene公司 GENI包括2-MP,12位的攝像頭,馬達驅動,六位置濾光輪,和一個電動變焦。

使用方便

鑒于您可以期待凝膠文件系統的使用量,易用性是一個關鍵考慮因素。

“實驗室應該考慮我(例如,實驗室經理)使用的容易程度,以及我将需要培訓多少人,” Bio-Rad實驗室成像營銷經理Ryan Short說。“或者,系統是否如此直觀,您可以立即行走并立即使用它?”

Hayes-Ozello的購買決定考慮了簡單性,因為她購買的系統是部門資源。“隻需極少的培訓,用戶就可以拍照并快樂地走,”她說。“它不需要核心經理的大量培訓......這才是我們真正想要的。”

易用性難以量化,Short承認,但有一些因素需要考慮。例如,拍攝照片需要多少操作相機設置,以及這些任務的自動化程度如何?“伱可以走到系統,按幾個按鈕,拍出好照片,還是伱需要調整焦距,變焦和光圈?” 他問。

軟件

當然,易用性計算的一部分是用于捕獲和分析圖像的軟件。即使是**基本的凝膠文檔系統也包括采集軟件,它應該允許用戶控制亮度,變焦和聚焦。但并非所有系統都能讓您分析圖像(例如,識别泳道,量化特定條帶中的DNA量,并測量其分子量)。

例如,AlphaImager Mini包括采集軟件,但分析軟件是可選的。但是,AlphaImager HP包括兩種标準。另一方面,Syngene的GeneTools分析軟件包及其所有凝膠文件系統,産品和銷售支持專家Maggie Pochyla說。“我們的核心競争力之一就是軟件,”她說。

在考慮系統附帶的軟件時,還要考慮如何使用該系統的後勤。采集軟件隻需要安裝在與設備相關的計算機上,但分析軟件呢?大多數研究人員可能更願意在他們自己的計算機上處​​理這些數字,特别是如果凝膠文檔系統在核心設施中或有一個隊列使用它。“伱不想站在機器旁邊進行分析,”肖特說。

因此,請詢問系統捆綁了多少軟件許可證,以及您收到多少次升級(或者您有多長時間獲得這些許可證)。如果分析軟件已聯網,請務必與您的IT部門核實,以避免任何安裝問題。

什物

基本的凝膠文件系統并不多,但正如他們所說,魔鬼在細節中。考慮到這一點,這裡還有一些其他選擇:

系統是否可升級?
例如,如果您現在不需要化學發光或熒光,但預計在未來幾年内需要這些功能,您可以升級現有系統,還是必須購買一個全新的系統?“每個人都會選擇這種模塊化的軟件和硬件,”Pochyla說,“所以伱不必購買勞斯萊斯,伱可以買到伱需要的東西。”

什麼是系統足迹?
在大多數實驗室中,空間非常寶貴,因此系統越小越好。一些凝膠doc系統由相關的PC控制; 其他(例如Syngene GENi和Cell Biosciences Red)具有帶觸摸屏界面的内置計算機。

伱将如何檢索伱的數據?(通過網絡?使用USB密鑰?)
将圖像轉換為出版品質的數字有多容易?軟件可以自動導出到高分辨率圖像(通常為300 dpi或更高),還是必須使用其他軟件(如Adobe Photoshop)來執行此操作?

供應商多久更新一次軟件?
凝膠文件系統的使用壽命大約為七到八年,估計很短,因此提前考慮很重要。“伱想确保系統提供對當前操作系統的訪問,”他說。

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